Viry a bakterie, bojte se!
Prudký rozvoj genomiky spolu s rostoucí výkonností počítačů poskytuje nové možnosti, jak rychle a spolehlivě určit viry a bakterie. A to jak v lidském těle postiženém infekcí, tak například při kontrole nezávadnosti pitné vody.
Dnes už není problém provést rychlý test, který ve vzorku rozpozná krátké úseky DNA, které jsou specifické pro viry nebo bakterie. Adam Phillippy s kolegy z Marylandské univerzity nyní vytvořil program, který takto objevenou DNA bleskově porovná s tisíci vzorků uložených v databázi. Článek demonstrující funkci programu při určení kmenů bakterie cholery vyšel tento týden v časopise PLoS Computational Biology.
Program pojmenovaný Insignia je rychlejší a přesnější než jeho předchůdci a hlavně - je volně ke stažení na stránkách autorů. Za posledních deset let světové laboratoře přečetly kompletní genomy stovek bakterií a tisíců virů. I ty jsou ve volně přístupných databázích. Odborníci z nejrůznějších oborů od medicíny po ekologii tak mají k dispozici mocný nástroj, o kterém si před několika málo lety mohli nechat jenom zdát.
Nejposlouchanější
E-shop Českého rozhlasu
Víte, kde spočívá náš společný ukrytý poklad? Blíž, než si myslíte!
Jan Rosák, moderátor
Slovo nad zlato
Víte, jaký vztah mají politici a policisté? Kde se vzalo slovo Vánoce? Za jaké slovo vděčí Turci husitům? Že se mladým paním původně zapalovalo něco úplně jiného než lýtka? Že segedínský guláš nemá se Segedínem nic společného a že známe na den přesně vznik slova dálnice? Takových objevů je plná knížka Slovo nad zlato. Tvoří ji výběr z rozhovorů moderátora Jana Rosáka s dřívějším ředitelem Ústavu pro jazyk český docentem Karlem Olivou, které vysílal Český rozhlas Dvojka.
