Viry a bakterie, bojte se!
Prudký rozvoj genomiky spolu s rostoucí výkonností počítačů poskytuje nové možnosti, jak rychle a spolehlivě určit viry a bakterie. A to jak v lidském těle postiženém infekcí, tak například při kontrole nezávadnosti pitné vody.
Dnes už není problém provést rychlý test, který ve vzorku rozpozná krátké úseky DNA, které jsou specifické pro viry nebo bakterie. Adam Phillippy s kolegy z Marylandské univerzity nyní vytvořil program, který takto objevenou DNA bleskově porovná s tisíci vzorků uložených v databázi. Článek demonstrující funkci programu při určení kmenů bakterie cholery vyšel tento týden v časopise PLoS Computational Biology.
Program pojmenovaný Insignia je rychlejší a přesnější než jeho předchůdci a hlavně - je volně ke stažení na stránkách autorů. Za posledních deset let světové laboratoře přečetly kompletní genomy stovek bakterií a tisíců virů. I ty jsou ve volně přístupných databázích. Odborníci z nejrůznějších oborů od medicíny po ekologii tak mají k dispozici mocný nástroj, o kterém si před několika málo lety mohli nechat jenom zdát.
Nejposlouchanější
E-shop Českého rozhlasu
Kdo jste vy? Klára, nebo učitel?
Tereza Kostková, moderátorka ČRo Dvojka
Jak Klára obrátila všechno vzhůru nohama
Knížka režiséra a herce Jakuba Nvoty v překladu Terezy Kostkové předkládá malým i velkým čtenářům dialogy malé Kláry a učitele o světě, který se dá vnímat docela jinak, než jak se píše v učebnicích.
